Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD8P13378 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXD8P13378 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms