Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms