Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL11A1P12107 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL11A1P12107 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL11A1P12107 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL11A1P12107 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL11A1P12107 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COL11A1P12107 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COL11A1P12107 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL11A1P12107 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL11A1P12107 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL11A1P12107 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL11A1P12107 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COL11A1P12107 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms