Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MS4A1P11836 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms