Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms