Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF888P0CJ79 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF888P0CJ79 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF888P0CJ79 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF888P0CJ79 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF888P0CJ79 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF888P0CJ79 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF888P0CJ79 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF888P0CJ79 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF888P0CJ79 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF888P0CJ79 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF888P0CJ79 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF888P0CJ79 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF888P0CJ79 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF888P0CJ79 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF888P0CJ79 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF888P0CJ79 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF888P0CJ79 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF888P0CJ79 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF888P0CJ79 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF888P0CJ79 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms