Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms