Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00032P0C843 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms