Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms