Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB1P08034 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB1P08034 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB1P08034 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB1P08034 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB1P08034 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB1P08034 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB1P08034 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB1P08034 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB1P08034 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB1P08034 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB1P08034 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB1P08034 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB1P08034 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB1P08034 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB1P08034 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB1P08034 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB1P08034 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB1P08034 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB1P08034 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB1P08034 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB1P08034 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB1P08034 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB1P08034 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB1P08034 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB1P08034 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB1P08034 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB1P08034 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB1P08034 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB1P08034 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB1P08034 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB1P08034 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB1P08034 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB1P08034 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB1P08034 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB1P08034 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB1P08034 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB1P08034 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB1P08034 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB1P08034 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB1P08034 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB1P08034 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB1P08034 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB1P08034 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB1P08034 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB1P08034 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB1P08034 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB1P08034 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB1P08034 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB1P08034 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB1P08034 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB1P08034 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB1P08034 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB1P08034 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB1P08034 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB1P08034 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB1P08034 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB1P08034 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB1P08034 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB1P08034 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB1P08034 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB1P08034 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB1P08034 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB1P08034 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB1P08034 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB1P08034 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB1P08034 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB1P08034 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB1P08034 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB1P08034 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB1P08034 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB1P08034 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB1P08034 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB1P08034 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB1P08034 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB1P08034 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB1P08034 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB1P08034 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB1P08034 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB1P08034 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB1P08034 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB1P08034 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB1P08034 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB1P08034 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB1P08034 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB1P08034 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB1P08034 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB1P08034 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB1P08034 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB1P08034 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB1P08034 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB1P08034 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB1P08034 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB1P08034 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB1P08034 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB1P08034 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GJB1P08034 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB1P08034 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB1P08034 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB1P08034 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms