Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEFMP07197 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEFMP07197 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEFMP07197 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEFMP07197 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEFMP07197 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEFMP07197 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEFMP07197 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEFMP07197 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEFMP07197 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEFMP07197 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEFMP07197 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEFMP07197 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEFMP07197 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEFMP07197 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEFMP07197 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEFMP07197 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEFMP07197 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEFMP07197 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEFMP07197 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NEFMP07197 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEFMP07197 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEFMP07197 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEFMP07197 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEFMP07197 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEFMP07197 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEFMP07197 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEFMP07197 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEFMP07197 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEFMP07197 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEFMP07197 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEFMP07197 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEFMP07197 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEFMP07197 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEFMP07197 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEFMP07197 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEFMP07197 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEFMP07197 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEFMP07197 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NEFMP07197 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEFMP07197 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEFMP07197 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEFMP07197 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEFMP07197 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEFMP07197 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEFMP07197 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEFMP07197 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEFMP07197 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEFMP07197 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEFMP07197 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEFMP07197 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEFMP07197 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEFMP07197 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEFMP07197 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEFMP07197 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEFMP07197 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEFMP07197 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEFMP07197 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEFMP07197 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEFMP07197 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEFMP07197 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEFMP07197 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEFMP07197 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEFMP07197 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEFMP07197 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEFMP07197 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEFMP07197 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEFMP07197 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEFMP07197 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEFMP07197 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEFMP07197 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEFMP07197 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEFMP07197 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEFMP07197 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEFMP07197 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEFMP07197 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEFMP07197 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NEFMP07197 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEFMP07197 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEFMP07197 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEFMP07197 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEFMP07197 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEFMP07197 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEFMP07197 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEFMP07197 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEFMP07197 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEFMP07197 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEFMP07197 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEFMP07197 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NEFMP07197 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEFMP07197 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NEFMP07197 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEFMP07197 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEFMP07197 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEFMP07197 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEFMP07197 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEFMP07197 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEFMP07197 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEFMP07197 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEFMP07197 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms