Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC4A1P02730 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC4A1P02730 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC4A1P02730 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC4A1P02730 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A1P02730 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A1P02730 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A1P02730 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A1P02730 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms