Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms