Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EGFRP00533 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EGFRP00533 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EGFRP00533 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EGFRP00533 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EGFRP00533 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EGFRP00533 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EGFRP00533 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EGFRP00533 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EGFRP00533 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EGFRP00533 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EGFRP00533 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EGFRP00533 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EGFRP00533 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EGFRP00533 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EGFRP00533 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EGFRP00533 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EGFRP00533 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EGFRP00533 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EGFRP00533 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EGFRP00533 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EGFRP00533 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EGFRP00533 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EGFRP00533 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EGFRP00533 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EGFRP00533 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EGFRP00533 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EGFRP00533 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EGFRP00533 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EGFRP00533 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EGFRP00533 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EGFRP00533 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EGFRP00533 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EGFRP00533 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EGFRP00533 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EGFRP00533 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EGFRP00533 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EGFRP00533 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EGFRP00533 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EGFRP00533 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EGFRP00533 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EGFRP00533 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EGFRP00533 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EGFRP00533 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EGFRP00533 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EGFRP00533 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EGFRP00533 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EGFRP00533 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EGFRP00533 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EGFRP00533 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EGFRP00533 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EGFRP00533 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EGFRP00533 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EGFRP00533 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EGFRP00533 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EGFRP00533 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EGFRP00533 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EGFRP00533 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EGFRP00533 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EGFRP00533 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EGFRP00533 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EGFRP00533 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EGFRP00533 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EGFRP00533 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EGFRP00533 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EGFRP00533 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EGFRP00533 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EGFRP00533 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EGFRP00533 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EGFRP00533 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EGFRP00533 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EGFRP00533 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EGFRP00533 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EGFRP00533 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EGFRP00533 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EGFRP00533 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EGFRP00533 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EGFRP00533 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EGFRP00533 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EGFRP00533 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EGFRP00533 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EGFRP00533 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EGFRP00533 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EGFRP00533 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EGFRP00533 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EGFRP00533 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EGFRP00533 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EGFRP00533 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EGFRP00533 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EGFRP00533 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EGFRP00533 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EGFRP00533 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EGFRP00533 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EGFRP00533 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EGFRP00533 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EGFRP00533 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EGFRP00533 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EGFRP00533 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EGFRP00533 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EGFRP00533 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms