Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLDN7O95471 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN7O95471 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms