Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms