Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLIT2O94813 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLIT2O94813 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLIT2O94813 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLIT2O94813 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLIT2O94813 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLIT2O94813 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SLIT2O94813 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SLIT2O94813 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLIT2O94813 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SLIT2O94813 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLIT2O94813 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLIT2O94813 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLIT2O94813 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLIT2O94813 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLIT2O94813 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLIT2O94813 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SLIT2O94813 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SLIT2O94813 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms