Protein–RNA interactions for Protein: O75678

RFPL2, Ret finger protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL2O75678 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFPL2O75678 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFPL2O75678 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFPL2O75678 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RFPL2O75678 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFPL2O75678 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFPL2O75678 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFPL2O75678 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFPL2O75678 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFPL2O75678 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFPL2O75678 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFPL2O75678 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFPL2O75678 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFPL2O75678 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFPL2O75678 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFPL2O75678 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFPL2O75678 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFPL2O75678 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFPL2O75678 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFPL2O75678 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RFPL2O75678 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFPL2O75678 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFPL2O75678 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFPL2O75678 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFPL2O75678 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFPL2O75678 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms