Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPS6KA4O75676 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPS6KA4O75676 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPS6KA4O75676 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPS6KA4O75676 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPS6KA4O75676 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPS6KA4O75676 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPS6KA4O75676 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPS6KA4O75676 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPS6KA4O75676 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPS6KA4O75676 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RPS6KA4O75676 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPS6KA4O75676 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPS6KA4O75676 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPS6KA4O75676 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPS6KA4O75676 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPS6KA4O75676 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPS6KA4O75676 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPS6KA4O75676 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPS6KA4O75676 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPS6KA4O75676 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RPS6KA4O75676 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RPS6KA4O75676 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms