Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms