Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX3O75364 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX3O75364 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX3O75364 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX3O75364 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX3O75364 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX3O75364 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX3O75364 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX3O75364 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX3O75364 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX3O75364 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX3O75364 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX3O75364 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX3O75364 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX3O75364 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX3O75364 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX3O75364 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX3O75364 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX3O75364 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX3O75364 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX3O75364 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX3O75364 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX3O75364 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX3O75364 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX3O75364 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX3O75364 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX3O75364 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX3O75364 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX3O75364 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX3O75364 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX3O75364 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX3O75364 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX3O75364 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX3O75364 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX3O75364 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX3O75364 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX3O75364 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX3O75364 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX3O75364 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX3O75364 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX3O75364 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX3O75364 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX3O75364 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX3O75364 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX3O75364 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX3O75364 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX3O75364 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX3O75364 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX3O75364 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX3O75364 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX3O75364 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX3O75364 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX3O75364 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX3O75364 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX3O75364 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX3O75364 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX3O75364 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX3O75364 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX3O75364 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX3O75364 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX3O75364 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX3O75364 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX3O75364 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX3O75364 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX3O75364 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX3O75364 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX3O75364 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX3O75364 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX3O75364 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX3O75364 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX3O75364 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX3O75364 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX3O75364 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX3O75364 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX3O75364 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX3O75364 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX3O75364 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX3O75364 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX3O75364 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX3O75364 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX3O75364 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX3O75364 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX3O75364 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX3O75364 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX3O75364 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX3O75364 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX3O75364 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX3O75364 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX3O75364 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX3O75364 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX3O75364 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX3O75364 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX3O75364 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX3O75364 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX3O75364 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX3O75364 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PITX3O75364 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX3O75364 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX3O75364 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX3O75364 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms