Protein–RNA interactions for Protein: O60760

HPGDS, Hematopoietic prostaglandin D synthase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDSO60760 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HPGDSO60760 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPGDSO60760 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPGDSO60760 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPGDSO60760 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPGDSO60760 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPGDSO60760 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPGDSO60760 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPGDSO60760 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPGDSO60760 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPGDSO60760 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms