Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEMFO60524 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEMFO60524 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEMFO60524 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEMFO60524 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEMFO60524 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEMFO60524 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEMFO60524 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEMFO60524 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEMFO60524 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEMFO60524 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEMFO60524 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEMFO60524 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEMFO60524 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEMFO60524 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEMFO60524 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEMFO60524 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEMFO60524 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEMFO60524 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEMFO60524 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEMFO60524 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEMFO60524 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEMFO60524 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEMFO60524 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEMFO60524 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEMFO60524 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEMFO60524 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEMFO60524 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEMFO60524 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEMFO60524 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEMFO60524 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEMFO60524 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NEMFO60524 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMFO60524 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMFO60524 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMFO60524 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMFO60524 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMFO60524 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMFO60524 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMFO60524 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMFO60524 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMFO60524 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMFO60524 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMFO60524 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMFO60524 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMFO60524 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMFO60524 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMFO60524 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMFO60524 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMFO60524 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMFO60524 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMFO60524 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMFO60524 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMFO60524 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEMFO60524 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEMFO60524 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEMFO60524 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEMFO60524 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEMFO60524 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEMFO60524 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEMFO60524 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEMFO60524 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEMFO60524 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEMFO60524 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEMFO60524 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEMFO60524 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEMFO60524 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEMFO60524 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEMFO60524 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEMFO60524 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEMFO60524 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEMFO60524 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEMFO60524 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEMFO60524 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEMFO60524 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEMFO60524 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEMFO60524 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMFO60524 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMFO60524 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMFO60524 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMFO60524 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMFO60524 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMFO60524 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMFO60524 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMFO60524 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMFO60524 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMFO60524 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMFO60524 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMFO60524 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMFO60524 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMFO60524 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMFO60524 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMFO60524 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMFO60524 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEMFO60524 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEMFO60524 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEMFO60524 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEMFO60524 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEMFO60524 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEMFO60524 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms