Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KIF1CO43896 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KIF1CO43896 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KIF1CO43896 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KIF1CO43896 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KIF1CO43896 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KIF1CO43896 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KIF1CO43896 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KIF1CO43896 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KIF1CO43896 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KIF1CO43896 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KIF1CO43896 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KIF1CO43896 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KIF1CO43896 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KIF1CO43896 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KIF1CO43896 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KIF1CO43896 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KIF1CO43896 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KIF1CO43896 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KIF1CO43896 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KIF1CO43896 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KIF1CO43896 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KIF1CO43896 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KIF1CO43896 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KIF1CO43896 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KIF1CO43896 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KIF1CO43896 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KIF1CO43896 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms