Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMAD6O43541 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD6O43541 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD6O43541 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD6O43541 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD6O43541 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms