Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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HOXA3O43365 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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HOXA3O43365 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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HOXA3O43365 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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HOXA3O43365 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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HOXA3O43365 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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HOXA3O43365 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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HOXA3O43365 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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HOXA3O43365 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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HOXA3O43365 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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