Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRODHO43272 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRODHO43272 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRODHO43272 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRODHO43272 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRODHO43272 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRODHO43272 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRODHO43272 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PRODHO43272 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRODHO43272 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PRODHO43272 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PRODHO43272 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRODHO43272 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRODHO43272 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRODHO43272 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRODHO43272 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRODHO43272 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRODHO43272 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRODHO43272 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRODHO43272 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRODHO43272 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRODHO43272 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRODHO43272 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRODHO43272 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRODHO43272 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PRODHO43272 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRODHO43272 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRODHO43272 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRODHO43272 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRODHO43272 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRODHO43272 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRODHO43272 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRODHO43272 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRODHO43272 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRODHO43272 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRODHO43272 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRODHO43272 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRODHO43272 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRODHO43272 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRODHO43272 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRODHO43272 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRODHO43272 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRODHO43272 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRODHO43272 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRODHO43272 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PRODHO43272 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRODHO43272 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PRODHO43272 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRODHO43272 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRODHO43272 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRODHO43272 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRODHO43272 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRODHO43272 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRODHO43272 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRODHO43272 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRODHO43272 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRODHO43272 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRODHO43272 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRODHO43272 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRODHO43272 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRODHO43272 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRODHO43272 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRODHO43272 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRODHO43272 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRODHO43272 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRODHO43272 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRODHO43272 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRODHO43272 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PRODHO43272 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRODHO43272 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRODHO43272 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRODHO43272 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRODHO43272 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRODHO43272 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRODHO43272 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PRODHO43272 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRODHO43272 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRODHO43272 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRODHO43272 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRODHO43272 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRODHO43272 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRODHO43272 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRODHO43272 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRODHO43272 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRODHO43272 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRODHO43272 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRODHO43272 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRODHO43272 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRODHO43272 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRODHO43272 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRODHO43272 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRODHO43272 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRODHO43272 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRODHO43272 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRODHO43272 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRODHO43272 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRODHO43272 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRODHO43272 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRODHO43272 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRODHO43272 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms