Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RGPD8O14715 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RGPD8O14715 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD8O14715 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD8O14715 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD8O14715 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD8O14715 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD8O14715 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD8O14715 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD8O14715 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD8O14715 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD8O14715 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RGPD8O14715 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RGPD8O14715 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RGPD8O14715 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RGPD8O14715 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD8O14715 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RGPD8O14715 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD8O14715 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD8O14715 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD8O14715 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD8O14715 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD8O14715 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD8O14715 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD8O14715 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD8O14715 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD8O14715 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD8O14715 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD8O14715 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD8O14715 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD8O14715 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD8O14715 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD8O14715 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD8O14715 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD8O14715 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RGPD8O14715 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RGPD8O14715 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms