Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms