Protein–RNA interactions for Protein: O00501

CLDN5, Claudin-5, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5O00501 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms