Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BQV1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BQV1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BQV1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BQV1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BQV1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BQV1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BQV1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BQV1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BQV1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BQV1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BQV1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BQV1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BQV1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BQV1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BQV1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BQV1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BQV1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BQV1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BQV1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BQV1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BQV1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BQV1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BQV1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BQV1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BQV1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BQV1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BQV1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BQV1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BQV1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BQV1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BQV1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BQV1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BQV1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BQV1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BQV1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
H3BQV1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
H3BQV1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
H3BQV1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
H3BQV1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BQV1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BQV1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BQV1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BQV1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BQV1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BQV1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BQV1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BQV1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BQV1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BQV1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BQV1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BQV1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BQV1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BQV1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BQV1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BQV1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BQV1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BQV1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BQV1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BQV1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BQV1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BQV1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BQV1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BQV1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BQV1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BQV1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BQV1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BQV1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BQV1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BQV1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BQV1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BQV1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BQV1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BQV1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BQV1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BQV1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BQV1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BQV1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BQV1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BQV1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BQV1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BQV1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BQV1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BQV1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BQV1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BQV1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BQV1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BQV1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BQV1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BQV1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BQV1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BQV1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BQV1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BQV1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BQV1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BQV1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BQV1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BQV1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BQV1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BQV1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms