Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms