Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO7DNF2Z398 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms