Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRRM5B3KS81 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms