Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ISM1B1AKI9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ISM1B1AKI9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ISM1B1AKI9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ISM1B1AKI9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ISM1B1AKI9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ISM1B1AKI9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ISM1B1AKI9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ISM1B1AKI9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ISM1B1AKI9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ISM1B1AKI9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ISM1B1AKI9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ISM1B1AKI9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms