Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms