Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP73A6NFT4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms