Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L4A6NEF3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms