Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms