Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POTEFA5A3E0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms