Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms