Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6S9

RPS6KL1, Ribosomal protein S6 kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1Q9Y6S9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KL1Q9Y6S9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms