Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms