Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms