Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms