Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U2

TSSC4, Protein TSSC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC4Q9Y5U2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSC4Q9Y5U2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSC4Q9Y5U2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms