Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms