Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms