Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms