Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms